A Eikon Therapeutics lida com o crescimento explosivo de dados com a Qumulo
Eikon Therapeutics é uma empresa de biotecnologia em fase clínica que desenvolve terapias inovadoras por meio da integração estratégica da engenharia e da ciência. Sua equipe de especialistas em biologia, química medicinal e farmacologia analisa o comportamento de proteínas em moléculas individuais dentro de células vivas, com o objetivo de descobrir novas terapias medicamentosas em potencial. Isso é feito por meio do rastreamento, da medição e da análise da dinâmica das proteínas, a fim de identificar quais medicamentos podem prolongar ou melhorar a vida dos pacientes que enfrentam doenças graves. Para realizar esse trabalho que envolve grande volume de dados, a empresa conta com uma infraestrutura tecnológica robusta que inclui o Qumulo.
Durante uma palestra recente, o CEO da Qumulo, Bill Richter, destacou: “Existem milhares de proteínas que desempenham papéis importantes nos organismos vivos, mas pouco se sabe sobre elas.”
Como parte da conversa, Patrick McNamara, diretor de engenharia de computação da Eikon Therapeutics, explicou um dos principais elementos de sua pilha tecnológica – a microscopia de fluorescência de super-resolução em células vivas, criada pelo cofundador Eric Betzig, PhD, e outros colaboradores. O Dr. Betzig ganhou o Prêmio Nobel em 2014 por seu trabalho nessa
área.
Como base da pilha tecnológica do Eikon, o Rastreamento de Molécula Única (SMT) utiliza corante fluorescente e vídeo para observar e medir os movimentos entre proteínas em uma célula viva. Isso é feito com grande detalhamento — por meio de imagens de vídeo de alta resolução com altas taxas de quadros, o que resulta em grandes volumes de dados
a serem gerenciados.
O gerenciamento do armazenamento de dados não estruturados atende às necessidades da empresa
Os dados estão presentes em quase todos os aspectos dos negócios da Eikon. “É isso que nos tornará uma empresa de sucesso”, explicou McNamara. À medida que a empresa cresce, se expande e realiza pesquisas para aprimorar seus pipelines biológicos e químicos, os dados gerados por seus instrumentos SMT continuam a crescer a taxas exponenciais. Eles precisam manter os dados protegidos e acessíveis, dadas as sérias implicações de suas pesquisas; e, com planos de continuar evoluindo em sua descoberta de medicamentos baseados em proteínas, a Eikon se interessou pela Qumulo devido à sua proteção de dados, escalabilidade, compatibilidade com a nuvem e recursos diferenciados.
“Fiz uma pesquisa bastante aprofundada quando estávamos fazendo nossa primeira aquisição de solução de armazenamento. Considerando nosso conjunto de dados e o que precisaremos fazer no futuro, recursos como acesso por API, replicação e o Qumulo Shift são essenciais para o gerenciamento dos nossos dados”, afirmou McNamara.
O conjunto de dados do Eikon é extenso tanto em tamanho quanto em número de arquivos, o que implica um trabalho considerável de curadoria e envelhecimento de dados. Para expandir facilmente o armazenamento em mais de uma ordem de magnitude desde a aquisição inicial, de pequena escala, em 2020, McNamara valoriza o fato de haver pouco ou nenhum impacto no ambiente operacional. “Basta clicar em um botão, voltar um dia depois e tudo já está reequilibrado. Para mim, isso é uma grande vantagem”, acrescentou ele.
A Eikon se prepara para um ambiente de dados dinâmico e baseado na nuvem
A Eikon estima que, em breve, estará gerando quase um petabyte de dados por dia.
Trabalhamos com SMB, NFS e armazenamento de objetos, e não precisar me preocupar em configurar algo que adapte o modo de comunicação do nosso array de armazenamento ao Linux, ao Windows ou a outros protocolos facilita muito a minha vida e ajuda nossa equipe científica a acessar os dados de que precisa.
Patrick McNamara
Diretor de Engenharia de Computação, Eikon Therapeutics
No próximo ano, a Eikon espera expandir a geração e o consumo de dados para vários locais e, provavelmente, também para a nuvem. Sua equipe de armazenamento continuará relativamente pequena, por isso a empresa precisa contar com parceiros de tecnologia confiáveis e de confiança para ajudá-la a acompanhar o ritmo. A Qumulo é uma parceira de confiança da Eikon, oferecendo armazenamento simples de implementar e fácil de gerenciar. Além disso, a Eikon tem a opção de implantar a plataforma de dados em arquivos multicloud da Qumulo quando expandir para a nuvem, o que gera maior valor de parceria para McNamara, sua equipe em crescimento e a liderança da Eikon Therapeutics.
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