Eikon Therapeutics bewältigt das explosive Datenwachstum mit Qumulo
Eikon Therapeutics ist ein Biotech-Unternehmen im klinischen Stadium, das durch die gezielte Integration von Technik und Wissenschaft bahnbrechende Therapeutika vorantreibt. Das Team aus Experten für Biologie, medizinische Chemie und Pharmakologie analysiert das Verhalten einzelner Proteinmoleküle in lebenden Zellen, um potenzielle neue medikamentöse Therapien zu entdecken. Dies geschieht durch die Verfolgung, Messung und Analyse der Proteindynamik, um herauszufinden, welche Medikamente das Leben von Patienten mit schweren Erkrankungen verlängern oder verbessern können. Um diese datenintensive Arbeit zu bewältigen, stützt sich das Unternehmen auf eine robuste Technologieplattform, zu der auch Qumulo gehört.
Bei einem Vortrag vor kurzem betonte Bill Richter, CEO von Qumulo: „Es gibt Tausende von Proteinen, die in lebenden Organismen eine wichtige Rolle spielen, doch über sie ist nur wenig bekannt.“
Im Rahmen des Gesprächs erläuterte Patrick McNamara, Director of Engineering Compute bei Eikon Therapeutics, eines der Kernelemente ihres Technologie-Stacks – die Superauflösungs-Fluoreszenzmikroskopie an lebenden Zellen, die vom Mitbegründer Dr. Eric Betzig und weiteren Mitarbeitern entwickelt wurde. Dr. Betzig erhielt 2014 den Nobelpreis für seine Arbeit auf
diesem Gebiet.
Als Grundlage des Technologie-Stacks von Eikon nutzt das Single-Molecule-Tracking (SMT) Fluoreszenzfarbstoffe und Videoaufnahmen, um Bewegungen zwischen Proteinen in einer lebenden Zelle sichtbar zu machen und zu messen. Dies geschieht äußerst detailliert – mithilfe hochauflösender Videoaufnahmen mit hohen Bildraten, was zu enormen Datenmengen führt,
die verwaltet werden müssen.
Die Verwaltung der Speicherung unstrukturierter Daten unterstützt die geschäftlichen Anforderungen
Daten durchdringen nahezu alle Aspekte der Geschäftstätigkeit von Eikon. „Sie sind der Schlüssel zu unserem Erfolg“, erklärte McNamara. Während das Unternehmen wächst, expandiert und Forschungsarbeiten zur Verbesserung seiner biologischen und chemischen Pipelines durchführt, nimmt die von den SMT-Geräten generierte Datenmenge weiterhin exponentiell zu. Angesichts der weitreichenden Auswirkungen ihrer Forschung müssen die Daten sowohl geschützt als auch zugänglich bleiben. Da Eikon plant, seine proteingestützte Wirkstoffforschung weiterzuentwickeln, entschied sich das Unternehmen für Qumulo aufgrund dessen Datensicherheit, Skalierbarkeit, Cloud-Kompatibilität und einzigartiger Funktionen.
„Als wir unsere erste Speicherlösung angeschafft haben, habe ich mich ziemlich intensiv mit dem Thema beschäftigt. Angesichts unseres Datenbestands und unserer zukünftigen Anforderungen sind Funktionen wie API-Zugriff, Replikation und Qumulo Shift für unser Datenmanagement von entscheidender Bedeutung“, sagte McNamara.
Der Datensatz von Eikon ist sowohl hinsichtlich der Größe als auch der Anzahl der Dateien umfangreich, was einen erheblichen Aufwand für die Datenbereinigung und -alterung mit sich bringt. Um den Speicherplatz seit der anfänglichen, kleinen Anschaffung im Jahr 2020 problemlos um mehr als eine Größenordnung erweitern zu können, schätzt McNamara es, dass dies kaum bis gar keine Auswirkungen auf die Betriebsumgebung hat. „Wir können auf eine Schaltfläche klicken, am nächsten Tag wiederkommen, und alles ist neu ausbalanciert. Das ist in meinen Augen ein großer Vorteil“, fügte er hinzu.
Eikon bereitet sich auf eine dynamische, cloudbasierte Datenumgebung vor
Eikon geht davon aus, dass das Unternehmen bald fast ein Petabyte an Daten pro Tag generieren wird.
Wir nutzen SMB, NFS und Objekt-Speicher, und da wir uns keine Gedanken darüber machen müssen, eine Lösung einzurichten, die die Kommunikationsweise unseres Speicher-Arrays in Linux, Windows oder andere Protokolle übersetzt, wird mir das Leben erleichtert und unser wissenschaftliches Team kann problemlos auf die gewünschten Daten zugreifen.
Patrick McNamara
Leiter der Abteilung „Engineering Compute“, Eikon Therapeutics
Im kommenden Jahr plant Eikon, die Datengenerierung und -nutzung auf mehrere Standorte und voraussichtlich auch in die Cloud auszuweiten. Da das Speicherteam des Unternehmens relativ klein bleiben wird, ist es auf zuverlässige, bewährte Technologiepartner angewiesen, um mit dieser Entwicklung Schritt halten zu können. Qumulo ist ein bewährter Partner für Eikon und bietet einfach zu implementierende und leicht zu verwaltende Speicherlösungen. Außerdem hat Eikon die Möglichkeit, die Multi-Cloud-Dateidatenplattform von Qumulo einzusetzen, wenn das Unternehmen in die Cloud expandiert – was für McNamara, sein wachsendes Team und die Führungsspitze von Eikon Therapeutics einen größeren Mehrwert aus dieser Partnerschaft schafft.
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